Za sigurno skladištenje, jaja kupljena u trgovini treba čuvati u frižideru. Ipak, postoji određeni vremenski period tokom kojeg mogu stajati na sobnoj temperaturi.
Prema Američkom odboru za jaja (American Egg Board), jaja mogu stajati na pultu otprilike dva sata na sobnoj temperaturi, odnosno jedan sat ako je temperatura 32 °C ili viša.
Nakon isteka tog vremena, preporučuje se da se jaja bace i zamijene svježima jer promjena temperature može pogodovati razvoju bakterija. Jaja su posebno osjetljiva na salmonelu.
Kako bi se smanjio rizik od kontaminacije, preporučuje se da se jaja čuvaju u frižideru na temperaturi ispod 4 °C, da se odbace sva napukla jaja te da se nakon rukovanja sirovim jajima temeljito operu ruke i sav pribor koji je bio u kontaktu s njima.
Treba napomenuti da se jaja u Sjedinjenim Američkim Državama u marketima drže u frižiderima jer se prije prodaje peru i dezinfikuju, čime se uklanja njihov prirodni zaštitni sloj.
Ipak, u mnogim zemljama jaja se prodaju bez hlađenja i čuvaju se na sobnoj temperaturi. Neoprana jaja zadržavaju taj zaštitni premaz, koji im pomaže da duže ostanu svježa na sobnoj temperaturi, ali na njihovoj ljusci može biti prisutna bakterija salmonela.
